孕妇一旦发生腹泻，主要治疗措施是适当补液，补足因腹泻丢失的水分和电解质，尤其是钾离子，补充因腹泻而失去的热量，同时要密切观察胎儿情况是否良好，有无早产或流产的征兆。和常人不同，孕妇使用抗生素当特别小心，常用的多种抗生素与抗原虫药物，除有不良反应外，不少还有潜在的致畸可能，故在妊娠期，特别是怀孕前3个月禁用。
其他抗生素，如磺胺类、四环素类、喹诺酮类等对母亲及胎儿均有不良影响，亦应禁用。某些较缓和的抗腹泻剂，如高岭土、果胶可用，这些药物可吸收水分减少肠蠕动；活性炭片也不妨一试。思密达是一种八面礞托石，具有较大的吸附面，不被机体吸收，它不但具有上述特性，还可吸附一些致病菌，因而安全有效。一般说来，红霉素、氨苄青霉素对母婴都是安全的。
注意不要用鸦片类药物止泻，因这类药物可能造成细菌过度生长与重复感染，反而会加重腹泻。也可给病人服用一些微生态制剂，如丽珠肠乐、整肠生等，以调整肠道菌群，扶正祛邪。对有腹泻又即将临产的孕妇，应按肠道传染病行床边隔离，以保证婴儿及其他产妇的安全。
