抗精子抗体阳性最大的危害就是可能会导致不孕不育。在不孕不育症中，不要以为只有男性会患有抗精子抗体阳性，其实男女都有可能出现抗精子抗体阳性。
对于男性来说，患有抗精子抗体阳性主要表现为男性精子质量下降、活力减退、成活率不达标，甚至出现大量的畸形精子，使一些看来健壮的男性在不知不觉中丧失了正常的生殖能力。
而对于女性来说，抗精子抗体阳性具有杀伤、吞噬、凝集和制动精子的作用，往往使精卵结合受到致命的挫折，精子进入女性生殖道变得很困难。则出现不能正常受精、对精子产生排斥反应的情况。即使怀孕，也常常会导致流产早产，使生育受到严重干扰。
