虽然穿心莲有很多的功效，但是还是有需要注意的地方。特别是孕妇和小孩子，食用带有药效的菜肴要特别注意。因为穿心莲有终止妊娠的作用，所以怀孕的人最好不要食用穿心莲。其抗生育作用的机制与其具有抗孕德素作用和直接损伤绒毛细胞有关，因此，在平常饮食中应该多加注意。
除了孕妇不能吃穿心莲外，阳虚症及脾胃虚弱者也要少服用穿心莲。因为穿心莲具有清热解毒的功效，是属于比较寒凉的食物，所以脾胃虚弱者最好不要食用。能够食用穿心莲的人也不要大量食用穿心莲。因为穿心莲本身带有微量的毒性，适量的摄入对人体有帮助，但大量食用就会导致中毒。因此切记不能大量食用，并且食用穿心莲之前，也要确认一下自己有没有过敏现象。
