熟决明子由于其药性寒凉，有泄泻和降血压的作用，而不适合脾胃虚寒、脾虚泄泻及低血压等患者服用。为验证决明子的副作用，有科学实验显示：在营养完全的食物中加入不同比例的决明子，随药物比例增加而使大鼠体重降低，临床使用本品口服降血脂，服药后有9%的病例，初期有腹胀、腹泻和恶心，但可自行消失，不影响继续服药。
决明子是一味中草药材，是药三分毒。决明子性微寒，对于体质较为虚弱或服用过量的人来说容易导致拉肚子、腹泻，再者胃痛的人也是不宜饮用此茶。对于惯性便秘和高血压的人来说决明子茶可以作为平常茶水饮用，而肠道消化功能疲弱者却要加以注意不可久服。
值得注意的是：有泄泻症状或者低血压者慎用决明子的制剂。因为熟决明子其“主渲泻”的副作用，怀孕女性也一定注意对决明子的服用。最新研究发现，如果长期饮用，症状轻引发月经不规律，严重的甚至会使子宫内膜不正常，从而诱发早产。孕妇和经期中的女性不宜服用决明子茶。
