对付男性尿道炎，除了用抗生素之外，还有其他的疗法，毕竟抗生素使用多了会对人体产生副作用，身体会越来越虚弱呢。目前，男性尿道炎治疗方法主要有两种：尿道炎微波治疗仪、 非淋介导疗法治疗非淋，前一种治疗方法被使用更为普遍，同时也被很多医院推荐为首选疗法。
微波治疗仪是将微波、红外、离子导入融为一体的先进治疗设备，具有热量辐射范围大、杀菌灭菌作用强、适应范围广的突出优点，而引起尿道炎各种致病菌均具有耐寒不耐热的特性。微波热疗可将辐射温度控制在45－50摄氏度之间，20分钟左右即可使细菌死亡，并可在医师的控制下，同时对前列腺及后尿道各相邻部位进行照射。精选的抗菌消炎药物可在离子状态下同时导入。
红外光波则以更大的传导能力加强治疗的效果。这种以热疗为主体，配套疗法和精选药物相结合的综合治疗，可有效杀灭各部位的细菌和病毒，促进血液循环，增强新陈代谢，并可促使机体免疫力的恢复和提高。经过规定疗程的治疗，可以有效清除细菌病毒，并可消除尿道炎引起的炎症扩散和蔓延，有效解决了容易复发的问题。
