芹菜最好不与虾、海米、醋、黄瓜、南瓜、蛤蜊、鸡肉、兔肉、鳖肉、黄豆、菊花、蟹、蚬、毛蚶同食。
芹菜性凉质滑，脾胃虚寒、腹泻者不宜多食；芹菜有降血压功效，血压偏低者不宜多食。
婚育期男士应少吃芹菜，因为常吃芹菜能减少男性精子的数量，准备生育的男性最好就是忌食芹菜。
芹菜不宜过量食用。芹菜属光敏性的蔬菜，人吃了这些蔬菜后，体内的光敏性物质达到一定浓度时，经过阳光照射，就容易导致光敏性物质代谢障碍，可能导致皮炎。
芹菜与黄瓜不宜同食，芹菜含有丰富的维生素C，黄瓜含有维生素C分解酶，两者同食，芹菜的营养价值百科会降低；芹菜不宜和兔肉同食，会引起头发脱落；与鸡肉同食，会伤元气；与甲鱼同食，会引起中毒。
